http://www.caijing.com.cn/2010-09-21/110527484.html 2009年,肖传国手术对象的手术患儿,并无明显好转迹象,甚至还有恶化、“残上加残”的迹象。部分患儿家属因此起诉肖传国手术实施的郑州神源医院。在此情况下,方玄昌在其当时供职的《中国新闻周刊》,
组织记者对此进行了调查报道。此后,方玄昌转任《科学新闻》杂志执行主编,继续对此系列事件进行跟踪报道,全面揭露肖传国实施的手术存在的问题。
2009年12月,方玄昌再次撰写评论《中国式同行评议——可怕的缄默》,将泌尿外科同行对于这一存在明显问题的肖氏手术不敢进行同行评议的原因,进行了剖析。此后不久,肖传国在网络上公开点名攻击方舟子、方玄昌等人,并申明“有仇必报”。